Сергей Кенсаринович занимается проведением фармакоэпидемиологических и фармакоэкономических исследований, организацией службы фармаконадзора, а также изучением эффективности и безопасности новых препаратов. Зырянов С.К.- автор более 220 публикаций, 1 монографии, является соавтором Национального руководства по клинической фармакологии (Москва, 2010), а также членом редакционной коллегии многих уважаемых российских научных журналов. Сергей Кенсаринович — научный редактор журнала «Практическая пульмонология».
Ведет активную преподавательскую деятельность, совмещая ее с работой главного внештатного специалиста-эксперта Федеральной службы по надзору в сфере здравоохранения и социального развития РФ по Центральному Федеральному округу. Член профильной комиссии МЗ РФ по клинической фармакологии, член Экспертного Совета ВАК РФ по терапевтическим наукам.