Ведёт изучение проблем детских инфекций, склонных к эпидемическому распространению, в том числе «вновь возникающих».
Первым в стране описал ряд новых инфекционных заболеваний, в частности: бокавирусную и метапневмовирусную инфекцию, энтероагрегативный эшерихиоз, аденовирусную острую диарею, кампилобактериоз, кишечные вирусные инфекции, связанные с оказанием медицинской помощи, поражения печени при токсокарозе, выявил особенности сочетанного течения малярии у детей.
Автор более 500 научных трудов по инфекционным болезням у детей и педиатрии, из них: 9 монографий, глав в руководствах, 2 справочника для врачей, 4 учебника для вузов, более 15 публикаций в зарубежной печати; 7 патентов РФ на изобретения.
Под его руководством защищено 11 докторских и 36 кандидатских диссертаций.
Член редакционных коллегий 9 научных журналов, входящих в перечень ВАК, заместитель главного редактора журнала «Инфекционные болезни» (входит в международную реферативную базу Scopus), член редсовета журнала «Доктор.Ру».